Köklerin yerleştirilmesi yapılacak işleme göre farklılık göstermektedir. Safir yöntemine göre kökler tek tek ve dikkatli bir şekilde daha önce açılmış olan kanallara forseps ile yerleştirilirken, DHI yönteminde en az iki kişi tek kişi halinde kökleri kaleme yerleştirir ve bu kalemler ile nakil yapılır.
Kanalların açılması için uygulanan lokal anestezi, hastanın bu süre zarfında hiçbir şey hissetmemesini sağlayacağından bu işlem için ayrıca bir lokal anestezi veya uyuşturma işlemine gerek yoktur.
Operasyon sıralamasındaki son işlem olan foliküllerin yerleştirilmesi işlemi en az iki kişi tarafından gerçekleştirilir ancak folikül sayısının fazlalığına bağlı olarak operasyonun bu kısmında kişi sayısı artabilir. Bunun yapılmasındaki temel amaç donör bölgeden alınan saç köklerinin mümkün olduğunca kısa tutulmasıdır. Ayrıca donör bölgeden alınan greftlerin operasyon boyunca özel solüsyonlarla beslendiği, böylece köklerin dışarıda bekletildiği süre boyunca köklerin güçlendiği ve canlılıklarının korunduğu bilinmelidir.
Kanalların açılmasının tamamlanması ile birlikte özel bir solüsyon içerisinde beslenmiş ve güçlenmiş olan kökler daha önce açılmış olan kanallara teker teker ve sabırla bu süreç içerisinde yerleştirilir.
Mikroskop yardımı ile greftler belirlenir ve tekli greftler ön bölgedeki açık alana dikilmek üzere ayrı bir yerde bekletilir.
Bir greft alındığı andan itibaren en kısa sürede hava ile teması kesilir ve doku koruma amaçlı üretilmiş özel bir solüsyon içinde bekletilir. Ve bu işlem soğuk zincir ile gerçekleştirilir.
Kök sayısına göre değişmekle birlikte genellikle 2-3 saat civarında sürmektedir.
